大塚グループは、大塚ホールディングスと子会社169社、関連会社30社で構成される（2021年12月時点）。※子会社と関連会社の違いはコチラ
大塚ホールディングスの子会社
大塚ホールディングスの子会社は下記の通り。議決権の（ ）内は間接所有割合で内数。
| 子会社 | 議決権（%） |
| 大塚製薬㈱ | 100 |
| ㈱大塚製薬工場 | 100 |
| 大鵬薬品工業㈱ | 100 |
| 大塚倉庫㈱ | 100 |
| 大塚化学㈱ | 100 |
| 大塚電子㈱ | 95.0（95.0） |
| 大塚食品㈱ | 100 |
| イーエヌ大塚製薬㈱ | 60.0（60.0） |
| 大塚包装工業㈱ | 72.2（72.2） |
| 大塚テクノ㈱ | 100.0（100.0） |
| ㈱JIMRO | 99.9（99.9） |
| ㈱ジェイ・オー・ファーマ | 66.5（66.5） |
| 岡山大鵬薬品㈱ | 100.0（100.0） |
| エムジーシー大塚ケミカル㈱ | 51.0（51.0） |
| 大塚メディカルデバイス㈱ | 100 |
| 日本理化学工業㈱ | 61.0（61.0） |
| 大塚オーミ陶業㈱ | 93.0（93.0） |
| 大塚リッジ㈱ | 100.0（100.0） |
| 大塚ターフテック㈱ | 100.0（100.0） |
| 東山フイルム㈱ | 95.5（95.5） |
| 大塚ウエルネスベンディング㈱ | 100.0（100.0） |
| 大塚メカトロニクス㈱ | 63.0（63.0） |
| ㈱リリアム大塚 | 100.0（100.0） |
| 大塚デジタルヘルス㈱ | 85.0（85.0） |
| ㈱Biomedical Solutions | 100.0（100.0） |
| 大塚ビジネスサポート㈱ | 100.0（100.0） |
| 大鵬イノベーションズ合同会社 | 100.0（100.0） |
| ㈱エイ・トラックス | 100.0（100.0） |
| 大塚アメリカ Inc. | 100.0（100.0） |
| 大塚アメリカファーマシューティカル Inc. | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカルD&C Inc. | 100.0（100.0） |
| ファーマバイト LLC | 100.0（100.0） |
| ユコラ Inc. | 100.0（100.0） |
| クリスタルガイザーウォーターカンパニー | 100.0（100.0） |
| リッジヴィンヤーズ Inc. | 100.0（100.0） |
| ケンブリッジアイソトープラボラトリーズ Inc. | 100.0（100.0） |
| 大塚グローバル・インシュランス Inc. | 100.0（100.0） |
| アステックスファーマシューティカルズ Inc. | 100.0（100.0） |
| フードステイト Inc. | 100.0（100.0） |
| アバニアファーマシューティカルズ Inc. | 100.0（100.0） |
| 大鵬オンコロジー Inc. | 100.0（100.0） |
| 大塚ケミカルアメリカ Inc. | 100.0（100.0） |
| ODH Inc. | 100.0（100.0） |
| リコーメディカル Inc. | 100.0（100.0） |
| ビステラ Inc. | 100.0（100.0） |
| A&P Inphatec LLC | 100.0（100.0） |
| マクウェイド センター フォー ストラテジック リサーチ アンド ディベロップメント LLC | 100.0（100.0） |
| 大塚ニュートラシューティカル エマージング ベンチャー LLC | 100.0（100.0） |
| 大塚カナダファーマシューティカル Inc. | 100.0（100.0） |
| デイヤフーズ Inc. | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカルヨーロッパ Ltd. | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカル（U.K.） Ltd. | 100.0（100.0） |
| アステックスセラピューティクス Ltd. | 100.0（100.0） |
| ヴェリアンホールディングスリミテッド | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカル S.A. | 100.0（100.0） |
| ヘブロン S.A. | 100.0（100.0） |
| トロセレンイベリカ S.A. | 51.0（51.0） |
| 大塚ファーマ GmbH | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカル D&C ヨーロッパ GmbH | 100.0（100.0） |
| 大塚ノーベルプロダクツ GmbH | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマスカンジナビア AB | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカルフランス SAS | 100.0（100.0） |
| ナルドベル SAS | 100.0（100.0） |
| ニュートリション エ サンテ SAS | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカルイタリア S.r.l. | 100.0（100.0） |
| インターファーマプラハ a.s. | 100.0（100.0） |
| 大塚ファーマシューティカル（スイス） GmbH | 100.0（100.0） |
| 大鵬オンコロジーヨーロッパGmbH | 100.0（100.0） |
| 韓国大塚製薬㈱ | 70.0（70.0） |
| 韓国大塚電子㈱ | 100.0（100.0） |
| 韓国OIAA㈱ | 100.0（100.0） |
| KOC㈱ | 90.0（90.0） |
| 大塚（中国）投資有限公司 | 100.0（100.0） |
| 上海大塚食品有限公司 | 100.0（100.0） |
| 大塚（上海）薬物研究開発有限公司 | 100.0（100.0） |
| 四川大塚製薬有限公司 | 100.0（100.0） |
| 浙江大塚製薬有限公司 | 100.0（100.0） |
| 天津大塚飲料有限公司 | 69.3（69.3） |
| 蘇州大塚製薬有限公司 | 100.0（100.0） |
| 大塚製薬研発（北京）有限公司 | 100.0（100.0） |
| 大塚慎昌（広東）飲料有限公司 | 60.0（60.0） |
| 張家港大塚化学有限公司 | 92.0（92.0） |
| 南京大塚泰邦科技有限公司 | 100.0（100.0） |
| 芳維特（上海）健康科技有限公司 | 100.0（100.0） |
| 香港大塚製薬有限公司 | 100.0（100.0） |
| 台湾大塚製薬股份有限公司 | 74.4（74.4） |
| PT大塚インドネシア | 76.7（76.7） |
| PT大塚ジャヤインダー | 94.9（94.9） |
| PTメラピウタマファルマ | 99.9（99.9） |
| PTウィダトラバクティ | 90.0（90.0） |
| PTアメルタインダ大塚 | 94.4（94.4） |
| P.T.ラウタン大塚ケミカル | 70.0（70.0） |
| PT大塚ディストリビューションインドネシア | 99.0（99.0） |
| 大塚（フィリピン）製薬 Inc. | 100.0（100.0） |
| 大塚ソーラーフィリピン Inc. | 60.0（60.0） |
| 大塚ケミカルインディア㈱ | 99.8（99.8） |
| 大塚製薬インド㈱ | 100.0（100.0） |
| 大塚パキスタン Ltd. | 67.9（67.9） |
| 大塚タン ニュートリション Co., Ltd. | 96.7（96.7） |
| 大塚製薬ベトナム㈱ | 98.5（98.5） |
| 大塚製薬（マレーシア）㈱ | 100.0（100.0） |
| 大塚オーストラリア製薬 Pty Ltd. | 100.0（100.0） |
| ダイアトランズ大塚㈱ | 100.0（100.0） |
| エジプト大塚製薬㈱ | 80.6（80.6） |
| アブディ イブラヒム 大塚製薬㈱ | 50.0（50.0） |
| ジャスミン Ltda. | 100.0（100.0） |
その他 63社
大塚ホールディングスの関連会社
大塚ホールディングスの関連会社は下記の通り。議決権の（ ）内は間接所有割合で内数。
| 関連会社 | 議決権（%） |
| アース製薬㈱ | 24.4（24.4） |
| アース環境サービス㈱ | 22.9（22.9） |
| ニチバン㈱ | 32.6（32.6） |
| ネオス㈱ | 23.3（23.3） |
| ハイエスサービス㈱ | 49.0（49.0） |
| 大輪総合運輸㈱ | 49.0（49.0） |
| CGロクサーヌ LLC | 46.5（46.5） |
| クリスタルガイザーブランドホールディングス LLC | 50.0（50.0） |
| マイクロポートサイエンティフィックコーポレーション | 21.1（21.1） |
| 東亜大塚㈱ | 50.0（50.0） |
| 中国大塚製薬有限公司 | 50.0（50.0） |
| 広東大塚製薬有限公司 | 49.0（49.0） |
| 金車大塚股份有限公司 | 50.0（50.0） |
| タイ大塚製薬㈱ | 49.0（49.0） |
| アルマ S.A. | 49.0（49.0） |
| PTインドネシアディストリビューション HUB | 30.0（30.0） |
| 大塚ジプト㈱ | 50.0（50.0） |
その他 13社
※関連記事：大塚製薬と大鵬薬品、アース製薬、ニチバンの関係